Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms