Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms