Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX4P78413 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX4P78413 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX4P78413 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX4P78413 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX4P78413 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX4P78413 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX4P78413 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX4P78413 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX4P78413 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX4P78413 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX4P78413 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX4P78413 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX4P78413 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX4P78413 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX4P78413 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX4P78413 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX4P78413 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX4P78413 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX4P78413 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX4P78413 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX4P78413 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX4P78413 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX4P78413 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX4P78413 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX4P78413 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX4P78413 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX4P78413 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX4P78413 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX4P78413 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX4P78413 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX4P78413 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX4P78413 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX4P78413 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX4P78413 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX4P78413 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX4P78413 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX4P78413 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IRX4P78413 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IRX4P78413 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IRX4P78413 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IRX4P78413 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms