Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms