Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSNK2A1P68400 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms