Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL11P62913 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL11P62913 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL11P62913 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL11P62913 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL11P62913 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL11P62913 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL11P62913 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL11P62913 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL11P62913 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL11P62913 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL11P62913 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL11P62913 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL11P62913 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL11P62913 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL11P62913 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL11P62913 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL11P62913 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL11P62913 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL11P62913 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL11P62913 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL11P62913 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL11P62913 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL11P62913 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL11P62913 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL11P62913 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL11P62913 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL11P62913 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL11P62913 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL11P62913 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL11P62913 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL11P62913 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL11P62913 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL11P62913 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL11P62913 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL11P62913 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL11P62913 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms