Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP46P62068 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP46P62068 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP46P62068 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP46P62068 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP46P62068 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP46P62068 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP46P62068 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP46P62068 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP46P62068 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP46P62068 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP46P62068 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP46P62068 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP46P62068 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP46P62068 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP46P62068 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP46P62068 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP46P62068 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP46P62068 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP46P62068 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP46P62068 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP46P62068 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP46P62068 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP46P62068 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP46P62068 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP46P62068 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP46P62068 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP46P62068 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
USP46P62068 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP46P62068 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP46P62068 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP46P62068 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP46P62068 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP46P62068 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP46P62068 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP46P62068 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP46P62068 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP46P62068 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP46P62068 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP46P62068 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP46P62068 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP46P62068 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP46P62068 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP46P62068 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP46P62068 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP46P62068 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP46P62068 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP46P62068 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP46P62068 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP46P62068 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP46P62068 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP46P62068 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP46P62068 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP46P62068 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP46P62068 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP46P62068 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP46P62068 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP46P62068 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP46P62068 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP46P62068 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP46P62068 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP46P62068 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP46P62068 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP46P62068 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP46P62068 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms