Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVK11-1P61568 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK11-1P61568 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms