Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBP60709 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBP60709 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBP60709 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBP60709 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTBP60709 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBP60709 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms