Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBEYP58557 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBEYP58557 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBEYP58557 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YBEYP58557 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YBEYP58557 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YBEYP58557 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YBEYP58557 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YBEYP58557 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YBEYP58557 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YBEYP58557 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YBEYP58557 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YBEYP58557 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YBEYP58557 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBEYP58557 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBEYP58557 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBEYP58557 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBEYP58557 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBEYP58557 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBEYP58557 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBEYP58557 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YBEYP58557 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YBEYP58557 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YBEYP58557 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YBEYP58557 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YBEYP58557 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YBEYP58557 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YBEYP58557 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YBEYP58557 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YBEYP58557 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YBEYP58557 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YBEYP58557 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YBEYP58557 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YBEYP58557 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YBEYP58557 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YBEYP58557 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YBEYP58557 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YBEYP58557 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YBEYP58557 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YBEYP58557 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YBEYP58557 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YBEYP58557 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YBEYP58557 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YBEYP58557 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YBEYP58557 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
YBEYP58557 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
YBEYP58557 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YBEYP58557 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YBEYP58557 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms