Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CABP4P57796 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CABP4P57796 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CABP4P57796 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CABP4P57796 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP4P57796 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP4P57796 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP4P57796 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CABP4P57796 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP4P57796 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP4P57796 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP4P57796 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP4P57796 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP4P57796 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP4P57796 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP4P57796 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP4P57796 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP4P57796 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP4P57796 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP4P57796 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP4P57796 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP4P57796 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP4P57796 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP4P57796 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP4P57796 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP4P57796 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP4P57796 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP4P57796 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP4P57796 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP4P57796 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP4P57796 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP4P57796 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP4P57796 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP4P57796 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP4P57796 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP4P57796 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP4P57796 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP4P57796 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP4P57796 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP4P57796 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP4P57796 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP4P57796 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP4P57796 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP4P57796 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP4P57796 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP4P57796 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CABP4P57796 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CABP4P57796 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CABP4P57796 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CABP4P57796 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CABP4P57796 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP4P57796 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP4P57796 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP4P57796 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP4P57796 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP4P57796 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP4P57796 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP4P57796 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP4P57796 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP4P57796 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP4P57796 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP4P57796 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP4P57796 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP4P57796 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP4P57796 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP4P57796 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP4P57796 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP4P57796 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP4P57796 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP4P57796 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP4P57796 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP4P57796 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP4P57796 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP4P57796 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP4P57796 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP4P57796 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP4P57796 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP4P57796 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP4P57796 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP4P57796 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP4P57796 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP4P57796 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP4P57796 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP4P57796 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP4P57796 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP4P57796 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP4P57796 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP4P57796 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP4P57796 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP4P57796 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP4P57796 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP4P57796 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP4P57796 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP4P57796 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP4P57796 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP4P57796 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP4P57796 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP4P57796 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP4P57796 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP4P57796 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms