Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BACE1P56817 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BACE1P56817 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BACE1P56817 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BACE1P56817 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BACE1P56817 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BACE1P56817 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BACE1P56817 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BACE1P56817 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BACE1P56817 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BACE1P56817 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BACE1P56817 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BACE1P56817 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BACE1P56817 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BACE1P56817 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BACE1P56817 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BACE1P56817 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BACE1P56817 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BACE1P56817 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BACE1P56817 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BACE1P56817 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BACE1P56817 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BACE1P56817 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BACE1P56817 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BACE1P56817 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BACE1P56817 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BACE1P56817 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BACE1P56817 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BACE1P56817 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BACE1P56817 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BACE1P56817 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BACE1P56817 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BACE1P56817 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BACE1P56817 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BACE1P56817 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BACE1P56817 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BACE1P56817 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BACE1P56817 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BACE1P56817 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BACE1P56817 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BACE1P56817 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BACE1P56817 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BACE1P56817 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BACE1P56817 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BACE1P56817 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BACE1P56817 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BACE1P56817 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BACE1P56817 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BACE1P56817 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BACE1P56817 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BACE1P56817 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BACE1P56817 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BACE1P56817 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BACE1P56817 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BACE1P56817 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BACE1P56817 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BACE1P56817 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BACE1P56817 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BACE1P56817 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BACE1P56817 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BACE1P56817 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BACE1P56817 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BACE1P56817 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BACE1P56817 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BACE1P56817 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BACE1P56817 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BACE1P56817 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BACE1P56817 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BACE1P56817 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BACE1P56817 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BACE1P56817 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BACE1P56817 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BACE1P56817 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BACE1P56817 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BACE1P56817 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BACE1P56817 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BACE1P56817 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BACE1P56817 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BACE1P56817 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BACE1P56817 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BACE1P56817 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BACE1P56817 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BACE1P56817 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BACE1P56817 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BACE1P56817 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BACE1P56817 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BACE1P56817 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BACE1P56817 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BACE1P56817 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BACE1P56817 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BACE1P56817 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BACE1P56817 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BACE1P56817 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BACE1P56817 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BACE1P56817 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BACE1P56817 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BACE1P56817 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BACE1P56817 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BACE1P56817 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms