Protein–RNA interactions for Protein: P54687

BCAT1, Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAT1P54687 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAT1P54687 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms