Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YARSP54577 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YARSP54577 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YARSP54577 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YARSP54577 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YARSP54577 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YARSP54577 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YARSP54577 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YARSP54577 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YARSP54577 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YARSP54577 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YARSP54577 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YARSP54577 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YARSP54577 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YARSP54577 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YARSP54577 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YARSP54577 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YARSP54577 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YARSP54577 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YARSP54577 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YARSP54577 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YARSP54577 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YARSP54577 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YARSP54577 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YARSP54577 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YARSP54577 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YARSP54577 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YARSP54577 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YARSP54577 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YARSP54577 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YARSP54577 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YARSP54577 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YARSP54577 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YARSP54577 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YARSP54577 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YARSP54577 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YARSP54577 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YARSP54577 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YARSP54577 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YARSP54577 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YARSP54577 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YARSP54577 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YARSP54577 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YARSP54577 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YARSP54577 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YARSP54577 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YARSP54577 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YARSP54577 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YARSP54577 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YARSP54577 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YARSP54577 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
YARSP54577 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YARSP54577 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YARSP54577 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YARSP54577 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YARSP54577 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
YARSP54577 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
YARSP54577 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YARSP54577 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
YARSP54577 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
YARSP54577 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YARSP54577 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YARSP54577 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
YARSP54577 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
YARSP54577 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YARSP54577 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
YARSP54577 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YARSP54577 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YARSP54577 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YARSP54577 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YARSP54577 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YARSP54577 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YARSP54577 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YARSP54577 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YARSP54577 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YARSP54577 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YARSP54577 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YARSP54577 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YARSP54577 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YARSP54577 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YARSP54577 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YARSP54577 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YARSP54577 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YARSP54577 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YARSP54577 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YARSP54577 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YARSP54577 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YARSP54577 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YARSP54577 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YARSP54577 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YARSP54577 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YARSP54577 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YARSP54577 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YARSP54577 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YARSP54577 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YARSP54577 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YARSP54577 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YARSP54577 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YARSP54577 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YARSP54577 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms