Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms