Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms