Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV2P52735 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV2P52735 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV2P52735 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV2P52735 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV2P52735 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV2P52735 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV2P52735 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV2P52735 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV2P52735 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV2P52735 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV2P52735 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV2P52735 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV2P52735 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV2P52735 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV2P52735 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV2P52735 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV2P52735 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV2P52735 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV2P52735 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV2P52735 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV2P52735 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV2P52735 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV2P52735 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV2P52735 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV2P52735 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV2P52735 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV2P52735 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV2P52735 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV2P52735 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV2P52735 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV2P52735 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAV2P52735 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAV2P52735 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAV2P52735 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAV2P52735 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VAV2P52735 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAV2P52735 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAV2P52735 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAV2P52735 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAV2P52735 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VAV2P52735 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAV2P52735 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAV2P52735 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAV2P52735 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms