Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBP50607 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBP50607 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBP50607 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBP50607 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBP50607 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBP50607 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBP50607 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBP50607 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBP50607 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBP50607 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBP50607 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBP50607 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBP50607 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBP50607 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBP50607 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBP50607 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBP50607 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBP50607 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBP50607 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBP50607 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBP50607 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBP50607 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBP50607 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBP50607 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBP50607 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBP50607 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBP50607 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBP50607 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBP50607 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBP50607 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBP50607 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBP50607 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBP50607 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBP50607 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBP50607 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBP50607 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBP50607 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBP50607 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBP50607 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBP50607 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBP50607 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBP50607 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBP50607 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBP50607 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBP50607 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBP50607 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBP50607 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBP50607 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBP50607 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBP50607 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBP50607 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBP50607 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBP50607 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBP50607 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBP50607 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBP50607 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBP50607 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBP50607 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBP50607 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBP50607 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBP50607 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBP50607 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBP50607 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBP50607 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBP50607 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBP50607 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBP50607 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBP50607 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBP50607 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBP50607 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBP50607 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBP50607 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms