Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLK2P49760 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLK2P49760 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK2P49760 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK2P49760 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK2P49760 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK2P49760 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK2P49760 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK2P49760 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK2P49760 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK2P49760 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK2P49760 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLK2P49760 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLK2P49760 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLK2P49760 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLK2P49760 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLK2P49760 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLK2P49760 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLK2P49760 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLK2P49760 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLK2P49760 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLK2P49760 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK2P49760 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK2P49760 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK2P49760 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK2P49760 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK2P49760 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK2P49760 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK2P49760 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK2P49760 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK2P49760 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK2P49760 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK2P49760 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK2P49760 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK2P49760 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK2P49760 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK2P49760 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK2P49760 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK2P49760 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK2P49760 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK2P49760 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK2P49760 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK2P49760 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK2P49760 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK2P49760 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK2P49760 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK2P49760 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK2P49760 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK2P49760 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms