Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR3P49682 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms