Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPIAP49247 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPIAP49247 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPIAP49247 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPIAP49247 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPIAP49247 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPIAP49247 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPIAP49247 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPIAP49247 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPIAP49247 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPIAP49247 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPIAP49247 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPIAP49247 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPIAP49247 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPIAP49247 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPIAP49247 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPIAP49247 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPIAP49247 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPIAP49247 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPIAP49247 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPIAP49247 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPIAP49247 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPIAP49247 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPIAP49247 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPIAP49247 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPIAP49247 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPIAP49247 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPIAP49247 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPIAP49247 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPIAP49247 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPIAP49247 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPIAP49247 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPIAP49247 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPIAP49247 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPIAP49247 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPIAP49247 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPIAP49247 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPIAP49247 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPIAP49247 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPIAP49247 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPIAP49247 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPIAP49247 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPIAP49247 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPIAP49247 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPIAP49247 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPIAP49247 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPIAP49247 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPIAP49247 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPIAP49247 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPIAP49247 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPIAP49247 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPIAP49247 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPIAP49247 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPIAP49247 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPIAP49247 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPIAP49247 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPIAP49247 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPIAP49247 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPIAP49247 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPIAP49247 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPIAP49247 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPIAP49247 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms