Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC1P48547 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms