Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLMP48507 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLMP48507 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLMP48507 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLMP48507 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLMP48507 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLMP48507 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLMP48507 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLMP48507 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLMP48507 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLMP48507 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLMP48507 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLMP48507 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLMP48507 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLMP48507 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLMP48507 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLMP48507 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLMP48507 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLMP48507 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLMP48507 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLMP48507 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLMP48507 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLMP48507 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLMP48507 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLMP48507 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLMP48507 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLMP48507 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLMP48507 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLMP48507 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLMP48507 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLMP48507 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLMP48507 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLMP48507 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLMP48507 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLMP48507 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLMP48507 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLMP48507 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLMP48507 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLMP48507 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLMP48507 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLMP48507 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLMP48507 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLMP48507 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLMP48507 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLMP48507 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLMP48507 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLMP48507 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLMP48507 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLMP48507 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLMP48507 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLMP48507 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLMP48507 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLMP48507 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLMP48507 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLMP48507 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLMP48507 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCLMP48507 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCLMP48507 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCLMP48507 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCLMP48507 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCLMP48507 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCLMP48507 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLMP48507 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLMP48507 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLMP48507 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLMP48507 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLMP48507 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLMP48507 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLMP48507 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLMP48507 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLMP48507 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLMP48507 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLMP48507 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLMP48507 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLMP48507 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLMP48507 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLMP48507 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLMP48507 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLMP48507 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLMP48507 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLMP48507 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLMP48507 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLMP48507 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCLMP48507 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms