Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA4P48169 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA4P48169 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms