Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms