Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP5P45974 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP5P45974 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP5P45974 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP5P45974 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP5P45974 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP5P45974 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP5P45974 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP5P45974 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP5P45974 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP5P45974 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP5P45974 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP5P45974 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP5P45974 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP5P45974 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP5P45974 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP5P45974 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP5P45974 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP5P45974 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP5P45974 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP5P45974 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP5P45974 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP5P45974 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP5P45974 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP5P45974 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP5P45974 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP5P45974 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP5P45974 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP5P45974 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP5P45974 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP5P45974 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP5P45974 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP5P45974 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP5P45974 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP5P45974 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP5P45974 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP5P45974 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP5P45974 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP5P45974 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP5P45974 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USP5P45974 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP5P45974 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP5P45974 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP5P45974 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP5P45974 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP5P45974 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP5P45974 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP5P45974 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP5P45974 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP5P45974 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP5P45974 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP5P45974 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP5P45974 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP5P45974 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms