Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSKP43235 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSKP43235 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSKP43235 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSKP43235 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSKP43235 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSKP43235 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSKP43235 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSKP43235 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSKP43235 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSKP43235 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSKP43235 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSKP43235 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSKP43235 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSKP43235 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSKP43235 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSKP43235 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSKP43235 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSKP43235 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSKP43235 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSKP43235 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSKP43235 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSKP43235 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSKP43235 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSKP43235 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTSKP43235 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTSKP43235 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTSKP43235 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSKP43235 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSKP43235 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSKP43235 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSKP43235 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSKP43235 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSKP43235 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSKP43235 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSKP43235 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSKP43235 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSKP43235 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSKP43235 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSKP43235 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSKP43235 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSKP43235 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSKP43235 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSKP43235 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSKP43235 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSKP43235 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSKP43235 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSKP43235 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSKP43235 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSKP43235 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSKP43235 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSKP43235 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSKP43235 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSKP43235 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSKP43235 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSKP43235 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSKP43235 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSKP43235 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSKP43235 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSKP43235 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSKP43235 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSKP43235 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSKP43235 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSKP43235 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSKP43235 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSKP43235 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSKP43235 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSKP43235 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSKP43235 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSKP43235 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSKP43235 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSKP43235 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSKP43235 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSKP43235 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSKP43235 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSKP43235 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSKP43235 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSKP43235 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSKP43235 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSKP43235 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSKP43235 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSKP43235 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSKP43235 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSKP43235 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms