Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCAMP43121 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCAMP43121 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCAMP43121 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCAMP43121 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCAMP43121 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCAMP43121 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCAMP43121 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCAMP43121 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCAMP43121 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCAMP43121 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCAMP43121 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCAMP43121 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MCAMP43121 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCAMP43121 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCAMP43121 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCAMP43121 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCAMP43121 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCAMP43121 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCAMP43121 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCAMP43121 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCAMP43121 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCAMP43121 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCAMP43121 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCAMP43121 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCAMP43121 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCAMP43121 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCAMP43121 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MCAMP43121 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCAMP43121 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCAMP43121 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCAMP43121 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCAMP43121 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCAMP43121 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCAMP43121 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCAMP43121 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCAMP43121 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCAMP43121 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCAMP43121 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCAMP43121 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCAMP43121 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCAMP43121 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCAMP43121 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCAMP43121 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCAMP43121 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCAMP43121 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCAMP43121 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCAMP43121 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCAMP43121 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCAMP43121 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCAMP43121 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCAMP43121 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCAMP43121 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCAMP43121 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCAMP43121 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCAMP43121 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCAMP43121 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCAMP43121 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCAMP43121 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCAMP43121 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCAMP43121 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCAMP43121 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCAMP43121 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCAMP43121 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCAMP43121 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCAMP43121 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCAMP43121 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCAMP43121 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCAMP43121 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCAMP43121 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCAMP43121 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCAMP43121 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCAMP43121 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCAMP43121 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MCAMP43121 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCAMP43121 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCAMP43121 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCAMP43121 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCAMP43121 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCAMP43121 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCAMP43121 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCAMP43121 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCAMP43121 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCAMP43121 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCAMP43121 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCAMP43121 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MCAMP43121 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCAMP43121 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCAMP43121 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCAMP43121 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MCAMP43121 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCAMP43121 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCAMP43121 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCAMP43121 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MCAMP43121 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCAMP43121 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCAMP43121 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCAMP43121 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCAMP43121 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCAMP43121 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms