Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms