Protein–RNA interactions for Protein: P42357

HAL, Histidine ammonia-lyase, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HALP42357 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HALP42357 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HALP42357 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HALP42357 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HALP42357 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HALP42357 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HALP42357 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HALP42357 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HALP42357 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HALP42357 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HALP42357 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HALP42357 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HALP42357 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HALP42357 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HALP42357 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HALP42357 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HALP42357 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HALP42357 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HALP42357 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HALP42357 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HALP42357 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HALP42357 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HALP42357 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HALP42357 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HALP42357 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HALP42357 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HALP42357 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HALP42357 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HALP42357 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HALP42357 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HALP42357 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HALP42357 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HALP42357 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HALP42357 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HALP42357 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HALP42357 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HALP42357 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HALP42357 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HALP42357 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HALP42357 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HALP42357 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HALP42357 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HALP42357 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HALP42357 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HALP42357 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HALP42357 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HALP42357 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HALP42357 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HALP42357 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HALP42357 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HALP42357 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HALP42357 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HALP42357 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HALP42357 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HALP42357 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HALP42357 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HALP42357 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HALP42357 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HALP42357 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HALP42357 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HALP42357 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HALP42357 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HALP42357 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HALP42357 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HALP42357 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HALP42357 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HALP42357 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HALP42357 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HALP42357 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HALP42357 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HALP42357 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HALP42357 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HALP42357 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HALP42357 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HALP42357 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HALP42357 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HALP42357 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HALP42357 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HALP42357 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms