Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPOP42166 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPOP42166 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPOP42166 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPOP42166 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPOP42166 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPOP42166 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPOP42166 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPOP42166 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPOP42166 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPOP42166 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPOP42166 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPOP42166 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPOP42166 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMPOP42166 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMPOP42166 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMPOP42166 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMPOP42166 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMPOP42166 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TMPOP42166 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMPOP42166 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMPOP42166 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMPOP42166 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMPOP42166 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMPOP42166 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMPOP42166 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMPOP42166 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMPOP42166 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMPOP42166 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMPOP42166 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMPOP42166 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TMPOP42166 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMPOP42166 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMPOP42166 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TMPOP42166 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMPOP42166 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMPOP42166 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TMPOP42166 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMPOP42166 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMPOP42166 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMPOP42166 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMPOP42166 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMPOP42166 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMPOP42166 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMPOP42166 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPOP42166 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPOP42166 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPOP42166 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPOP42166 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPOP42166 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPOP42166 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPOP42166 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPOP42166 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPOP42166 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPOP42166 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPOP42166 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPOP42166 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPOP42166 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPOP42166 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPOP42166 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPOP42166 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPOP42166 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPOP42166 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPOP42166 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPOP42166 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPOP42166 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPOP42166 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPOP42166 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPOP42166 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPOP42166 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMPOP42166 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMPOP42166 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMPOP42166 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMPOP42166 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMPOP42166 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMPOP42166 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMPOP42166 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMPOP42166 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMPOP42166 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMPOP42166 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMPOP42166 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMPOP42166 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMPOP42166 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMPOP42166 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms