Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX2P40425 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX2P40425 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX2P40425 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX2P40425 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX2P40425 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX2P40425 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX2P40425 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX2P40425 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX2P40425 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX2P40425 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX2P40425 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX2P40425 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX2P40425 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX2P40425 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX2P40425 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX2P40425 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX2P40425 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX2P40425 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX2P40425 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX2P40425 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX2P40425 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX2P40425 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX2P40425 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX2P40425 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX2P40425 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX2P40425 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX2P40425 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX2P40425 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX2P40425 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX2P40425 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX2P40425 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX2P40425 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX2P40425 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX2P40425 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX2P40425 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX2P40425 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX2P40425 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX2P40425 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX2P40425 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX2P40425 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX2P40425 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX2P40425 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX2P40425 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX2P40425 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX2P40425 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX2P40425 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX2P40425 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX2P40425 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX2P40425 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX2P40425 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX2P40425 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX2P40425 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX2P40425 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX2P40425 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX2P40425 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX2P40425 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX2P40425 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX2P40425 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX2P40425 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX2P40425 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX2P40425 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX2P40425 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX2P40425 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX2P40425 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX2P40425 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX2P40425 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX2P40425 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX2P40425 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX2P40425 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX2P40425 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX2P40425 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX2P40425 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX2P40425 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX2P40425 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX2P40425 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX2P40425 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX2P40425 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX2P40425 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX2P40425 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX2P40425 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX2P40425 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX2P40425 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX2P40425 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX2P40425 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX2P40425 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX2P40425 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PBX2P40425 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PBX2P40425 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PBX2P40425 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX2P40425 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX2P40425 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX2P40425 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX2P40425 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX2P40425 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX2P40425 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms