Protein–RNA interactions for Protein: P38264

PHO88, SRP-independent targeting protein 3, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PHO88	P38264	YER067C-A	YER067C-A	324 nt		3.04	□□□□□ -1.92
PHO88	P38264	YER085C	YER085C	522 nt		3.04	□□□□□ -1.92
PHO88	P38264	YGL132W	YGL132W	336 nt		3.04	□□□□□ -1.92
PHO88	P38264	PSR1	YLL010C	1284 nt		3.04	□□□□□ -1.92
PHO88	P38264	YLL017W	YLL017W	312 nt		3.04	□□□□□ -1.92
PHO88	P38264	PAU23	YLR037C	375 nt		3.04	□□□□□ -1.92
PHO88	P38264	RPS31	YLR167W	459 nt		3.04	□□□□□ -1.92
PHO88	P38264	TMA10	YLR327C	261 nt		3.04	□□□□□ -1.92
PHO88	P38264	KRE5	YOR336W	4098 nt		3.04	□□□□□ -1.92
PHO88	P38264	CDC9	YDL164C	2268 nt		3.03	□□□□□ -1.92
PHO88	P38264	HPR1	YDR138W	2259 nt		3.03	□□□□□ -1.92
PHO88	P38264	MPC3	YGR243W	441 nt		3.03	□□□□□ -1.92
PHO88	P38264	DDI3	YNL335W	678 nt		3.03	□□□□□ -1.92
PHO88	P38264	YOR385W	YOR385W	873 nt		3.03	□□□□□ -1.92
PHO88	P38264	PTR3	YFR029W	2037 nt		3.03	□□□□□ -1.92
PHO88	P38264	TMA108	YIL137C	2841 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	CSR2	YPR030W	3366 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	SLN1	YIL147C	3663 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	APC11	YDL008W	498 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YFL065C	YFL065C	309 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	QCR10	YHR001W-A	234 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YPT35	YHR105W	645 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	CAP2	YIL034C	864 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	AIM22	YJL046W	1230 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YKR033C	YKR033C	426 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YLR257W	YLR257W	966 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	JIP3	YLR331C	378 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	SCD6	YPR129W	1050 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	POL12	YBL035C	2118 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	SRS2	YJL092W	3525 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	RNA14	YMR061W	2034 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	TSC11	YER093C	4293 nt		3.02	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	GAS2	YLR343W	1668 nt		3.01	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	GYP7	YDL234C	2241 nt		3.01	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YGR121W-A	YGR121W-A	216 nt		3.01	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	SRN2	YLR119W	642 nt		3.01	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	TIS11	YLR136C	858 nt		3.01	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	RPL23A	YBL087C	414 nt		3.01	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	TUM1	YOR251C	915 nt		3.01	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YPL107W	YPL107W	747 nt		3.01	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	AYT1	YLL063C	1425 nt		3.01	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	ITC1	YGL133W	3795 nt		3.01	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	PRM2	YIL037C	1971 nt		3	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YDR491C	YDR491C	492 nt		3	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	RRT13	YER066W	558 nt		3	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YGR053C	YGR053C	852 nt		3	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YKR075C	YKR075C	924 nt		3	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YOR186W	YOR186W	435 nt		3	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YPR015C	YPR015C	744 nt		3	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		3	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	TFA1	YKL028W	1449 nt		3	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	SLP1	YOR154W	1764 nt		3	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	PDR3	YBL005W	2931 nt		2.99	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YIL082W-A	YIL082W-A	4497 nt		2.99	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	TIM21	YGR033C	720 nt		2.99	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	VMA22	YHR060W	546 nt		2.99	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YFL040W	YFL040W	1623 nt		2.99	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	STP2	YHR006W	1626 nt		2.99	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	ENT1	YDL161W	1365 nt		2.99	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	ULP1	YPL020C	1866 nt		2.99	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	NEW1	YPL226W	3591 nt		2.99	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YHR032W-A	YHR032W-A	180 nt		2.98	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	PEX18	YHR160C	852 nt		2.98	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YLR402W	YLR402W	192 nt		2.98	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	TPP1	YMR156C	717 nt		2.98	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	MCA1	YOR197W	1299 nt		2.98	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	POL2	YNL262W	6669 nt		2.98	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	RNT1	YMR239C	1416 nt		2.98	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	RPN3	YER021W	1572 nt		2.98	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YJL132W	YJL132W	2253 nt		2.97	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	PHO13	YDL236W	939 nt		2.97	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	COS7	YDL248W	1152 nt		2.97	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	VPS41	YDR080W	2979 nt		2.97	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	ERV14	YGL054C	417 nt		2.97	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	PDX1	YGR193C	1233 nt		2.97	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	COS5	YJR161C	1152 nt		2.97	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YBR116C	YBR116C	528 nt		2.97	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	FLO10	YKR102W	3510 nt		2.97	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	YDR186C	YDR186C	2634 nt		2.97	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	IKI3	YLR384C	4050 nt		2.97	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	TCM62	YBR044C	1719 nt		2.96	□□□□□ -1.93
PHO88	P38264	ERG11	YHR007C	1593 nt		2.96	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	SPT16	YGL207W	3108 nt		2.96	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	PHO12	YHR215W	1404 nt		2.96	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	PHO11	YAR071W	1404 nt		2.96	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	GZF3	YJL110C	1656 nt		2.96	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	RAD55	YDR076W	1221 nt		2.96	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	PHM6	YDR281C	315 nt		2.96	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	YDR464C-A	YDR464C-A	189 nt		2.96	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	MOB2	YFL034C-B	864 nt		2.96	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	RPB9	YGL070C	369 nt		2.96	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	YKR047W	YKR047W	306 nt		2.96	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	NSE1	YLR007W	1011 nt		2.96	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	ANT1	YPR128C	987 nt		2.96	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	YBR134W	YBR134W	402 nt		2.96	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	PEP7	YDR323C	1548 nt		2.96	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	TFC4	YGR047C	3078 nt		2.95	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	APL4	YPR029C	2499 nt		2.95	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	YAP5	YIR018W	738 nt		2.95	□□□□□ -1.94
PHO88	P38264	PHD1	YKL043W	1101 nt		2.95	□□□□□ -1.94

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