Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL4P36578 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL4P36578 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL4P36578 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL4P36578 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL4P36578 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL4P36578 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL4P36578 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL4P36578 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL4P36578 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL4P36578 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL4P36578 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL4P36578 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL4P36578 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL4P36578 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL4P36578 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL4P36578 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL4P36578 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL4P36578 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL4P36578 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL4P36578 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL4P36578 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL4P36578 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL4P36578 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL4P36578 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL4P36578 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL4P36578 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL4P36578 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL4P36578 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL4P36578 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL4P36578 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL4P36578 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL4P36578 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL4P36578 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL4P36578 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms