Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.2 ms