Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT9P35527 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT9P35527 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT9P35527 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT9P35527 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT9P35527 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT9P35527 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT9P35527 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT9P35527 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT9P35527 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT9P35527 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT9P35527 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT9P35527 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT9P35527 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT9P35527 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT9P35527 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT9P35527 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT9P35527 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT9P35527 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT9P35527 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT9P35527 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT9P35527 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT9P35527 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT9P35527 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT9P35527 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT9P35527 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT9P35527 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT9P35527 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT9P35527 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT9P35527 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT9P35527 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT9P35527 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT9P35527 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT9P35527 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT9P35527 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT9P35527 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT9P35527 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT9P35527 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT9P35527 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT9P35527 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT9P35527 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT9P35527 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT9P35527 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT9P35527 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT9P35527 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT9P35527 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT9P35527 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT9P35527 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT9P35527 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT9P35527 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT9P35527 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT9P35527 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT9P35527 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT9P35527 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT9P35527 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT9P35527 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT9P35527 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT9P35527 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT9P35527 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms