Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA4P35212 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA4P35212 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA4P35212 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA4P35212 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA4P35212 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJA4P35212 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA4P35212 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA4P35212 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA4P35212 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA4P35212 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA4P35212 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJA4P35212 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA4P35212 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA4P35212 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA4P35212 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA4P35212 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA4P35212 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA4P35212 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA4P35212 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA4P35212 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA4P35212 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA4P35212 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA4P35212 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA4P35212 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA4P35212 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA4P35212 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA4P35212 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA4P35212 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA4P35212 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA4P35212 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA4P35212 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA4P35212 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA4P35212 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA4P35212 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA4P35212 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA4P35212 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA4P35212 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA4P35212 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA4P35212 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA4P35212 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA4P35212 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA4P35212 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA4P35212 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA4P35212 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA4P35212 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA4P35212 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA4P35212 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA4P35212 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA4P35212 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA4P35212 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA4P35212 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA4P35212 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA4P35212 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA4P35212 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA4P35212 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA4P35212 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA4P35212 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA4P35212 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA4P35212 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA4P35212 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA4P35212 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA4P35212 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA4P35212 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA4P35212 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA4P35212 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA4P35212 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA4P35212 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA4P35212 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA4P35212 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA4P35212 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA4P35212 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA4P35212 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA4P35212 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA4P35212 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA4P35212 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA4P35212 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA4P35212 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA4P35212 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA4P35212 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA4P35212 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA4P35212 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA4P35212 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA4P35212 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA4P35212 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA4P35212 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA4P35212 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA4P35212 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA4P35212 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA4P35212 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA4P35212 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA4P35212 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA4P35212 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA4P35212 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA4P35212 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA4P35212 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA4P35212 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA4P35212 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA4P35212 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA4P35212 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms