Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP6P35125 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP6P35125 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP6P35125 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP6P35125 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP6P35125 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP6P35125 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP6P35125 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP6P35125 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP6P35125 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP6P35125 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP6P35125 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
USP6P35125 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP6P35125 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP6P35125 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP6P35125 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP6P35125 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP6P35125 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP6P35125 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP6P35125 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP6P35125 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP6P35125 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP6P35125 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP6P35125 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
USP6P35125 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
USP6P35125 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP6P35125 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP6P35125 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP6P35125 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP6P35125 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
USP6P35125 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP6P35125 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP6P35125 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP6P35125 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP6P35125 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP6P35125 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP6P35125 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP6P35125 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP6P35125 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP6P35125 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP6P35125 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP6P35125 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP6P35125 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP6P35125 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP6P35125 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP6P35125 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USP6P35125 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP6P35125 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USP6P35125 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP6P35125 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP6P35125 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP6P35125 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP6P35125 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP6P35125 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP6P35125 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP6P35125 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP6P35125 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP6P35125 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP6P35125 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
USP6P35125 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP6P35125 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP6P35125 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP6P35125 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP6P35125 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP6P35125 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP6P35125 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
USP6P35125 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP6P35125 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP6P35125 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP6P35125 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP6P35125 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP6P35125 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP6P35125 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP6P35125 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP6P35125 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP6P35125 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP6P35125 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP6P35125 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
USP6P35125 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP6P35125 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP6P35125 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP6P35125 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP6P35125 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP6P35125 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP6P35125 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP6P35125 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP6P35125 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP6P35125 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP6P35125 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP6P35125 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP6P35125 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP6P35125 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
USP6P35125 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP6P35125 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP6P35125 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP6P35125 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP6P35125 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP6P35125 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP6P35125 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
USP6P35125 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms