Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRS3P32247 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRS3P32247 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRS3P32247 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRS3P32247 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRS3P32247 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRS3P32247 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRS3P32247 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRS3P32247 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRS3P32247 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRS3P32247 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRS3P32247 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms