Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 KCNMB3-201ENST00000314235 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AP001793.2-201ENST00000580267 780 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms