Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms