Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC27P30260 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC27P30260 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC27P30260 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC27P30260 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC27P30260 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC27P30260 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC27P30260 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC27P30260 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC27P30260 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC27P30260 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC27P30260 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC27P30260 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC27P30260 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC27P30260 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC27P30260 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC27P30260 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC27P30260 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC27P30260 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC27P30260 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC27P30260 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC27P30260 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC27P30260 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC27P30260 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC27P30260 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC27P30260 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC27P30260 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC27P30260 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC27P30260 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC27P30260 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC27P30260 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC27P30260 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC27P30260 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC27P30260 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC27P30260 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC27P30260 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC27P30260 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC27P30260 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC27P30260 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC27P30260 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC27P30260 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC27P30260 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC27P30260 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC27P30260 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDC27P30260 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC27P30260 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC27P30260 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC27P30260 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC27P30260 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC27P30260 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC27P30260 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC27P30260 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC27P30260 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC27P30260 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC27P30260 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC27P30260 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC27P30260 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC27P30260 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC27P30260 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC27P30260 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC27P30260 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC27P30260 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC27P30260 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC27P30260 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC27P30260 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC27P30260 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC27P30260 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC27P30260 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC27P30260 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC27P30260 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC27P30260 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC27P30260 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC27P30260 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC27P30260 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC27P30260 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC27P30260 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC27P30260 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC27P30260 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC27P30260 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC27P30260 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC27P30260 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms