Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CRABP1P29762 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRABP1P29762 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms