Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD34P28906 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD34P28906 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD34P28906 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD34P28906 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD34P28906 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD34P28906 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD34P28906 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD34P28906 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD34P28906 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD34P28906 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD34P28906 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD34P28906 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD34P28906 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD34P28906 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD34P28906 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD34P28906 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD34P28906 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD34P28906 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD34P28906 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD34P28906 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD34P28906 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD34P28906 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD34P28906 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD34P28906 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD34P28906 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD34P28906 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD34P28906 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD34P28906 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD34P28906 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD34P28906 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD34P28906 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD34P28906 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD34P28906 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms