Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBL1P28749 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBL1P28749 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBL1P28749 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBL1P28749 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBL1P28749 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBL1P28749 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBL1P28749 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBL1P28749 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RBL1P28749 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBL1P28749 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBL1P28749 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBL1P28749 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBL1P28749 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBL1P28749 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBL1P28749 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBL1P28749 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBL1P28749 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBL1P28749 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBL1P28749 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBL1P28749 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBL1P28749 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBL1P28749 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBL1P28749 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBL1P28749 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBL1P28749 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBL1P28749 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBL1P28749 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBL1P28749 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBL1P28749 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBL1P28749 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBL1P28749 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBL1P28749 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBL1P28749 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBL1P28749 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBL1P28749 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBL1P28749 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBL1P28749 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBL1P28749 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBL1P28749 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBL1P28749 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBL1P28749 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBL1P28749 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RBL1P28749 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBL1P28749 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBL1P28749 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBL1P28749 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBL1P28749 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBL1P28749 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBL1P28749 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBL1P28749 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBL1P28749 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBL1P28749 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBL1P28749 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBL1P28749 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBL1P28749 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBL1P28749 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBL1P28749 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBL1P28749 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBL1P28749 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBL1P28749 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBL1P28749 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBL1P28749 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBL1P28749 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBL1P28749 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBL1P28749 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBL1P28749 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBL1P28749 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBL1P28749 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBL1P28749 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBL1P28749 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBL1P28749 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBL1P28749 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBL1P28749 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBL1P28749 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBL1P28749 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBL1P28749 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RBL1P28749 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBL1P28749 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBL1P28749 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBL1P28749 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBL1P28749 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBL1P28749 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms