Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX2P28328 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX2P28328 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PEX2P28328 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PEX2P28328 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX2P28328 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX2P28328 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX2P28328 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX2P28328 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX2P28328 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX2P28328 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX2P28328 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX2P28328 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX2P28328 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX2P28328 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX2P28328 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX2P28328 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX2P28328 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX2P28328 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX2P28328 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX2P28328 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX2P28328 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX2P28328 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX2P28328 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX2P28328 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX2P28328 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX2P28328 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX2P28328 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX2P28328 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX2P28328 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX2P28328 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX2P28328 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX2P28328 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX2P28328 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX2P28328 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX2P28328 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX2P28328 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX2P28328 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX2P28328 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX2P28328 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX2P28328 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX2P28328 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX2P28328 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX2P28328 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX2P28328 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX2P28328 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX2P28328 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX2P28328 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX2P28328 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX2P28328 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX2P28328 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX2P28328 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX2P28328 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX2P28328 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX2P28328 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX2P28328 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX2P28328 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PEX2P28328 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX2P28328 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX2P28328 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX2P28328 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX2P28328 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX2P28328 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX2P28328 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX2P28328 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms