Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms