Protein–RNA interactions for Protein: P27796

POT1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 417 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POT1	P27796	APC9	YLR102C	798 nt		3.72	□□□□□ -1.81
POT1	P27796	RRG9	YNL213C	645 nt		3.72	□□□□□ -1.81
POT1	P27796	NOC2	YOR206W	2133 nt		3.72	□□□□□ -1.81
POT1	P27796	DIB1	YPR082C	432 nt		3.72	□□□□□ -1.81
POT1	P27796	YLR177W	YLR177W	1887 nt		3.72	□□□□□ -1.81
POT1	P27796	MSD1	YPL104W	1977 nt		3.72	□□□□□ -1.81
POT1	P27796	GYP6	YJL044C	1377 nt		3.72	□□□□□ -1.81
POT1	P27796	MTC4	YBR255W	2085 nt		3.71	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	TRM1	YDR120C	1713 nt		3.71	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	PCL2	YDL127W	927 nt		3.71	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	tF(GAA)D	tF(GAA)D	73 nt		3.71	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	tF(GAA)N	tF(GAA)N	73 nt		3.71	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	YER034W	YER034W	558 nt		3.71	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	YHR180W	YHR180W	492 nt		3.71	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	RPB3	YIL021W	957 nt		3.71	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	YNR063W	YNR063W	1824 nt		3.71	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	GAL11	YOL051W	3246 nt		3.71	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	RRN6	YBL014C	2685 nt		3.71	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	RSC1	YGR056W	2787 nt		3.71	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	PTM1	YKL039W	1572 nt		3.71	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	DSF2	YBR007C	2211 nt		3.71	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	REB1	YBR049C	2433 nt		3.71	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	YPR148C	YPR148C	1308 nt		3.7	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	YOR365C	YOR365C	2112 nt		3.7	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	ULS1	YOR191W	4860 nt		3.7	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	CTH1	YDR151C	978 nt		3.7	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	FCF1	YDR339C	570 nt		3.7	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	NSA2	YER126C	786 nt		3.7	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	BMH1	YER177W	804 nt		3.7	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	YHL045W	YHL045W	348 nt		3.7	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	MED11	YMR112C	396 nt		3.7	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	OCA2	YNL056W	594 nt		3.7	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	FSH3	YOR280C	801 nt		3.7	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	YPL109C	YPL109C	1974 nt		3.7	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	MSS4	YDR208W	2340 nt		3.7	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	ACA1	YER045C	1470 nt		3.69	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	PFA4	YOL003C	1137 nt		3.69	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	LDS2	YOL047C	1071 nt		3.69	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	YPL088W	YPL088W	1029 nt		3.69	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	MRPL51	YPR100W	423 nt		3.69	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	TRK1	YJL129C	3708 nt		3.69	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	ECM22	YLR228C	2445 nt		3.69	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	VMA1	YDL185W	3216 nt		3.68	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	RIM4	YHL024W	2142 nt		3.68	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	CIR1	YGR207C	786 nt		3.68	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	YNR068C	YNR068C	819 nt		3.68	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	CYC2	YOR037W	1101 nt		3.68	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	CAF20	YOR276W	486 nt		3.68	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	PWR1	PWR1	941 nt		3.68	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	NKP1	YDR383C	717 nt		3.67	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	tK(UUU)D	tK(UUU)D	73 nt		3.67	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	tK(UUU)G1	tK(UUU)G1	73 nt		3.67	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	tK(UUU)G2	tK(UUU)G2	73 nt		3.67	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	tK(UUU)K	tK(UUU)K	73 nt		3.67	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	tK(UUU)L	tK(UUU)L	73 nt		3.67	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	tK(UUU)O	tK(UUU)O	73 nt		3.67	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	tK(UUU)P	tK(UUU)P	73 nt		3.67	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	TDA8	YAL064C-A	381 nt		3.67	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	MOH1	YBL049W	417 nt		3.67	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	YMR310C	YMR310C	954 nt		3.67	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	YMR316C-A	YMR316C-A	312 nt		3.67	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	GRX1	YCL035C	333 nt		3.67	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	SRO7	YPR032W	3102 nt		3.66	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	ETP1	YHL010C	1758 nt		3.66	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	CHD1	YER164W	4407 nt		3.66	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	YPT35	YHR105W	645 nt		3.66	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	COA4	YLR218C	453 nt		3.66	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	MDJ2	YNL328C	441 nt		3.66	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	YOL024W	YOL024W	519 nt		3.66	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	YPR136C	YPR136C	513 nt		3.66	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	BAR1	YIL015W	1764 nt		3.66	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	SWH1	YAR042W	3567 nt		3.65	□□□□□ -1.82
POT1	P27796	DTD1	YDL219W	453 nt		3.65	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	HSP42	YDR171W	1128 nt		3.65	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	YDR355C	YDR355C	303 nt		3.65	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	YEL032C-A	YEL032C-A	162 nt		3.65	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	TAM41	YGR046W	1158 nt		3.65	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	IRC18	YJL037W	675 nt		3.65	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	MTD1	YKR080W	963 nt		3.65	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	YLR012C	YLR012C	300 nt		3.65	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	IZH2	YOL002C	954 nt		3.65	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	YOR263C	YOR263C	408 nt		3.65	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	YHR202W	YHR202W	1809 nt		3.65	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	STP1	YDR463W	1560 nt		3.64	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	RRP8	YDR083W	1179 nt		3.64	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	ENT3	YJR125C	1227 nt		3.64	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	RNH203	YLR154C	333 nt		3.64	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	REX4	YOL080C	870 nt		3.64	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	POS5	YPL188W	1245 nt		3.64	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	YSA1	YBR111C	696 nt		3.64	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	YBR137W	YBR137W	540 nt		3.64	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	GPI10	YGL142C	1851 nt		3.64	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	UBX5	YDR330W	1503 nt		3.64	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	ALG8	YOR067C	1734 nt		3.64	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	MSR1	YHR091C	1932 nt		3.64	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	TOP1	YOL006C	2310 nt		3.64	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	YDR089W	YDR089W	2610 nt		3.63	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	EBS1	YDR206W	2655 nt		3.63	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	SIN4	YNL236W	2925 nt		3.63	□□□□□ -1.83
POT1	P27796	MRH1	YDR033W	963 nt		3.63	□□□□□ -1.83

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