Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMLP26374 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMLP26374 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMLP26374 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMLP26374 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMLP26374 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMLP26374 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHMLP26374 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHMLP26374 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMLP26374 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMLP26374 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMLP26374 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMLP26374 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMLP26374 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMLP26374 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMLP26374 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMLP26374 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMLP26374 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMLP26374 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMLP26374 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMLP26374 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMLP26374 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMLP26374 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMLP26374 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMLP26374 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMLP26374 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMLP26374 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMLP26374 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMLP26374 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMLP26374 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMLP26374 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMLP26374 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMLP26374 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMLP26374 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMLP26374 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMLP26374 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMLP26374 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMLP26374 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMLP26374 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMLP26374 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMLP26374 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMLP26374 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMLP26374 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMLP26374 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMLP26374 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMLP26374 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMLP26374 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMLP26374 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMLP26374 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMLP26374 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMLP26374 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMLP26374 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMLP26374 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMLP26374 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMLP26374 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMLP26374 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMLP26374 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMLP26374 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMLP26374 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMLP26374 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMLP26374 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMLP26374 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMLP26374 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMLP26374 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMLP26374 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMLP26374 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMLP26374 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMLP26374 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMLP26374 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMLP26374 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMLP26374 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMLP26374 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMLP26374 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMLP26374 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMLP26374 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMLP26374 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMLP26374 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMLP26374 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMLP26374 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMLP26374 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMLP26374 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMLP26374 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMLP26374 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMLP26374 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMLP26374 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMLP26374 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMLP26374 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMLP26374 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMLP26374 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMLP26374 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMLP26374 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMLP26374 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMLP26374 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMLP26374 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHMLP26374 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMLP26374 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMLP26374 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMLP26374 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMLP26374 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHMLP26374 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms