Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.5 ms